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平成14年度に大学院の部局化・重点化を実施し、教員組織を大学院に移行しました。大学院を中心とした教育研究体制を敷き、高度な学問と研究を目指される方を多数受け入れています。毎年、学部卒業生の約半数が大学院に進学しています。また研究レベルは高い客観評価を受けており、朝日新聞社発行の大学ランキング2008年版によれば、工学分野における論文引用度指数は、兵庫県立大学が日本の第1位にランクされています。これは姫路工業大学だった2003年度版に引き続き2度目で、それだけ優秀な研究者がいるということです。